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由质谱分析数据建立肝癌病人与健康人血清的分类模型
由质谱分析数据建立肝癌病人与健康人血清的分类模型
作者:
刘银坤
徐琨
朱尔一
杨芃原
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
肝细胞癌
表面加强激光解析电离-飞行时间质谱
偏最小二乘变量筛选
分类模型
海量数据建模
摘要:
通过对质谱数据处理和分析,建立肝细胞癌(HCC)病人与健康人的分类模型,可以用来判别样本是否来源于肝癌病人.运用表面加强激光解析电离-飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)获取肝癌病人和健康人血清蛋白指纹图谱数据,并运用偏最小二乘(PLS)变量筛选法建立分类模型,最终得到分类模型的交叉检验相关系数达0.96以上,判别准确率大大提高.同时对模型进行分析,找出对肝癌病人和健康人的差异有重要影响的因素或变量.这些变量为30个质荷比区间内特定蛋白的峰强度值,反映这些质荷比区间内蛋白量的增加或减少与肝癌的形成有密切关系,可作为重要的生物标志物进一步加以研究.并且采用所得模型的拟合值等一些信息做分类图,能较好地表达回归模型的分类效果.
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文献信息
篇名
由质谱分析数据建立肝癌病人与健康人血清的分类模型
来源期刊
质谱学报
学科
化学
关键词
肝细胞癌
表面加强激光解析电离-飞行时间质谱
偏最小二乘变量筛选
分类模型
海量数据建模
年,卷(期)
2008,(5)
所属期刊栏目
研究报告
研究方向
页码范围
268-273
页数
6页
分类号
O657.63
字数
4199字
语种
中文
DOI
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
杨芃原
复旦大学化学系
114
952
18.0
27.0
5
刘银坤
复旦大学附属中山医院肝癌研究所
121
643
13.0
18.0
9
朱尔一
厦门大学化学化工学院现代分析科学教育部重点实验室
8
33
4.0
5.0
10
徐琨
厦门大学化学化工学院现代分析科学教育部重点实验室
2
5
1.0
2.0
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参考文献(0)
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参考文献(0)
二级参考文献(2)
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参考文献(0)
二级参考文献(2)
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参考文献(0)
二级参考文献(1)
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参考文献(0)
二级参考文献(2)
2003(6)
参考文献(1)
二级参考文献(5)
2004(6)
参考文献(2)
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2005(6)
参考文献(3)
二级参考文献(3)
2007(3)
参考文献(3)
二级参考文献(0)
2008(0)
参考文献(0)
二级参考文献(0)
引证文献(0)
二级引证文献(0)
2012(1)
引证文献(1)
二级引证文献(0)
2016(1)
引证文献(0)
二级引证文献(1)
研究主题发展历程
节点文献
肝细胞癌
表面加强激光解析电离-飞行时间质谱
偏最小二乘变量筛选
分类模型
海量数据建模
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
质谱学报
主办单位:
北京中科科仪技术发展有限责任公司
中国物理学会质谱分会
出版周期:
双月刊
ISSN:
1004-2997
CN:
11-2979/TH
开本:
大16开
出版地:
北京275信箱65分箱中国原子能科学研究院
邮发代号:
82-349
创刊时间:
1980
语种:
chi
出版文献量(篇)
1837
总下载数(次)
1
总被引数(次)
12922
相关基金
福建省自然科学基金
英文译名:
Natural Science Foundation of Fujian Province of China
官方网址:
http://www.fjinfo.gov.cn/fz/zrjj.htm
项目类型:
重大项目
学科类型:
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