采用PCR-DGGE技术分析蛋鸡肠道细菌种群结构及多样性

• 作者: GONG Joshua SHARIF Shayan YU Hai 倪学勤 周小秋 曾东
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 蛋鸡 肠道菌群 变性梯度凝胶电泳(DGGE) 多样性
• 年，卷（期）: 2008,（7）
• 所属期刊栏目: 预防兽医
• 页码范围: 955-961
• 页数: 7页
• 分类号: Q938.15
• 字数: 4824字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0366-6964.2008.07.019

摘要

利用基于16S rDNA的PCR-DGGE(变性梯度凝胶电泳)图谱技术结合特异性和共性条带割胶同收DNA进行克隆和测序,对2、4、6和8周龄蛋鸡嗉囊,十二指肠、空肠、回肠和盲肠内容物细菌群落的结构和多样性进行了比较,并鉴定了8周龄蛋鸡部分特异性和共性群落成员,分析蛋鸡年龄和肠段部位对微生物群落结构和多样性的影响.肠道菌群DGGE图谱显示肠道部位对细菌种群结构影响很大,盲肠内微生物的多样性最高,其次是回肠和空肠,嗉囊和十二指肠的微生物多样性比较低.十二指肠内细菌与其它肠段相比差异最大,其次是盲肠与其它肠段细菌组成的差异.随着蛋鸡周龄的增加,消化道微生物经历了由简单(2周)到复杂(4周),再回复简单(6周)到复杂(8周)的变化过程.DGGE图谱中共性条带序列分析表明8周龄蛋鸡消化道前段的优势细菌是三得利乳杆菌(Lactobacillus suntoryeus)、索氏梭菌(Clostridium sordellii)和大肠杆菌,盲肠中的特异性条带主要是各种不可培养的细菌以及超巨巨单胞菌(Megamonas hypermegale)和梭菌属细菌(Clostridium spp).该研究结果表明蛋鸡肠道部位决定细菌群落的结构和多样性,蛋鸡的周龄影响肠道细菌多样性.