水稻条纹病毒山东济宁分离物RSV-SD-JN2分子变异分析

• 作者: 宋云枝 朱常香 李开东 温孚江 马进
• 来源期刊: 植物保护学报
• 学科: 农学
• 关键词: 水稻条纹病毒 RNA3 RNA4 序列分析 分子变异
• 年，卷（期）: 2008,（5）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 415-420
• 页数: 6页
• 分类号: S4
• 字数: 4153字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0577-7518.2008.05.007

摘要

为从分子水平探讨强致病性水稻条纹病毒山东济宁分离物RSV-SD-JN2的变异及其致病性,采用RT-PCR技术,克隆RSV-SD-JN2的RNA3、RNA4区段cDNA.结果显示,RSV-SD-JN2的RNA3和RNA4核苷酸序列长度分别为2487、2157bp;RNA3中,NS3基因长为636bp,基因间隔区(IR)为725bp,CP基因为969bp;RNA4中,SP基因长为537bp,基因间隔区(IR)为654bp,NSvc4基因为861bp.不同时期、不同区域和不同致病性的RSV分离物的序列比较发现,RNA3、RNA4序列5′和3′末端非编码区具有高度保守性,仅存在个别碱基的差异;基因编码区保守性较高,核苷酸和氨基酸序列同源性分别在93%和97%以上,且大部分碱基变异为无意义变异;基因间隔区(IR)易于变异.RSV的分子变异与其地理分布具有密切的关系.RNA4的IR的变异导致RNA二级结构--发夹结构的稳定性提高是病毒致病性增强的重要原因.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	温孚江	山东农业大学作物生物学国家重点实验室	76	1663	25.0	39.0
2	朱常香	山东农业大学作物生物学国家重点实验室	57	1480	23.0	37.0
6	宋云枝	山东农业大学作物生物学国家重点实验室	33	908	17.0	30.0
10	马进	山东农业大学作物生物学国家重点实验室	1	3	1.0	1.0
11	李开东	山东农业大学作物生物学国家重点实验室	1	3	1.0	1.0