分枝杆菌在北京水源环境中的分布:M.arupense国内首次报告

• 作者: 张建中 蔡林 赵亭 陈雪
• 来源期刊: 临床皮肤科杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 分枝杆菌,非结核 表型鉴定 M.arupense 限制性片段长度多态性 序列分析
• 年，卷（期）: 2008,（1）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 13-16
• 页数: 4页
• 分类号: R378.91
• 字数: 3513字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-4963.2008.01.005

摘要

目的:研究北京水源中分枝杆菌的分布,应用表型鉴定方法和分子生物学方法进行分枝杆菌鉴定,并比较两种方法的准确性和优缺点.方法:采集水源环境标本,进行分枝杆菌分离培养,通过生化反应对所有分离株进行鉴定.同时从培养菌落中提取分枝杆菌DNA,用PCR扩增65 ku热休克蛋白基因,扩增产物分别应用两种限制性内切酶BstEⅡ和Hae Ⅲ酶切,进行限制性片段长度多态性(RFLP)分析和PCR产物的测序分析.结果:从30份养鱼水中分离出35株分枝杆菌.①表型鉴定结果:Runyon Ⅰ群1株,可疑为海分枝杆菌;Runyon Ⅱ群7株,确定为戈登分枝杆菌或疑似戈登分枝杆菌;Runyon Ⅲ群9株,未鉴定到种;Runyon Ⅳ群18株,其中龟-偶发分枝杆菌复合群9株,其余9株未鉴定到种.②PCR-RFLP鉴定结果:戈登分枝杆菌8株,龟-偶发分枝杆菌复合群8株(包括M.peregrinum 1株),疑似日内瓦分枝杆菌10株,其余9株未鉴定到种.③PCR产物测序鉴定:戈登分枝杆菌10株,M.arupense9株,偶发分枝杆菌7株,土分枝杆菌6株,不产色分枝杆菌1株,M.peregrinum 1株,脓肿分枝杆菌1株.结论:非结核分枝杆菌(NTM)广泛存在于养鱼水中,分枝杆菌采用65 ku热休克蛋白基因PCR扩增配合测序鉴定较传统表型鉴定和PCR-RFLP更准确.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张建中	北京大学人民医院皮肤科	340	1152	15.0	22.0
2	蔡林	北京大学人民医院皮肤科	74	402	9.0	15.0
3	陈雪	北京大学人民医院皮肤科	51	270	8.0	14.0
4	赵亭		12	83	6.0	8.0