蛋白质分子柔性对接方法研究进展

• 作者: 劳兴珍 王乐希 郑珩
• 来源期刊: 药物生物技术
• 学科: 生物学
• 关键词: 柔性对接 打分函数 对接取向 偶联作用 构象变化
• 年，卷（期）: 2008,（4）
• 所属期刊栏目: 综述
• 页码范围: 302-306
• 页数: 5页
• 分类号: Q51
• 字数: 6156字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1005-8915.2008.04.018

摘要

细胞内的很多重要生理过程,如细胞信号转导、免疫反应、基因复制、转录、翻译以及细胞周期调控等,都是通过蛋白质复合体或蛋白质分子间相互作用来完成的,因此要充分理解和认识这些复杂生理过程,必须要解析蛋?鞍 白质复合物结构并了解蛋白质相互作用过程发生的构象变化.然而当前研究结构的实验方法如X-射线衍射和核磁共振等,尚难以解析蛋白质复合物的结构,这使得理论模拟方法受到了越来越多的重视,并迅速发展和应用.早期蛋白质-蛋白质对接或蛋白质与小分子对接算法中,大都将目标蛋白简化处理为刚性分子,显然这种刚性简化过程可能会造成预测结果的很大偏差,随着计算机处理能力的增强,对蛋白质柔性进行处理的算法也得到了较大的发展.该综述主要介绍将分子柔性引入到对接中的一些新的思路和进展,包括在CAPRI中成功应用的一些方法工具,并就如何恰当地处理分子柔性和构象变化做阐述,同时提出了现阶段仍然面临的挑战以及未来解决的方向.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	郑珩	中国药科大学生命科学与技术学院	106	521	13.0	17.0
2	劳兴珍	中国药科大学生命科学与技术学院	36	122	7.0	9.0
3	王乐希	中国药科大学生命科学与技术学院	1	14	1.0	1.0