统计学筛选电脑预测的人H5N1毒株核蛋白B细胞表位

• 作者: 俞守义 柯昌文 黄平
• 来源期刊: 中华微生物学和免疫学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: HSN1病毒 核蛋白 B细胞表位 预测 筛选
• 年，卷（期）: 2008,（4）
• 所属期刊栏目: 疫苗学
• 页码范围: 363-367
• 页数: 5页
• 分类号: R3
• 字数: 4800字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0254-5101.2008.04.017

摘要

目的 预测并筛选人禽流感H5N1毒株核蛋白(NP)的B细胞抗原表位.方法 采用DNAStar Lasergene 7.1软件,进行人禽流感H5N1毒株NP基因核苷酸序列分析.采用Kyte-Doolittle的亲水性方法、Emini方法和Jameson-Wolf抗原指数方法,辅以对NP的二级结构中的柔性区域的分析,采用SPSS13.0进行聚类、相关和四分位数分析,建立一种统计学筛选程序,预测H5N1病毒NP的B细胞表位,并对毒株A/GD/01/06(H5N1)的NP变异进行评价.结果 预测并筛选最有可能的B细胞表位为位于NP的N端317～326、452～457、467～473、367～370、491～498、375～378、171～177、48～53、245～250、76～104肽段等.A/GD/01/06(H5N1)的NP通过氨基酸第370位(N370S)位点置换,增加一个糖基化位点(NES368-370)并改变NP的特性.结论 用多参数预测并统计学筛选H5N1毒株NP的B细胞表位,可以为分子免疫学研究和药物筛选提供依据.A/GD/01/06(H5N1)毒株NP氨基酸第370位(N370S)位点置换改变其抗原性,但抗原表位大小未变(SNEN367-370).

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	俞守义	南方医科大学流行病学系	142	1125	17.0	26.0
2	柯昌文	广东省疾病预防控制中心广东省应急病原学检测重点实验室	154	1211	18.0	26.0
3	黄平	广东省疾病预防控制中心广东省应急病原学检测重点实验室	60	448	11.0	16.0