海南普通野生稻不同居群rDNA ITS区序列的比较分析

• 作者: 刘恩平 孔华 彭于发 林海妹 王晓玲 贺立卡 郭安平
• 来源期刊: 热带作物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 普通野生稻 核糖体DNA ITS区 序列分析
• 年，卷（期）: 2008,（4）
• 所属期刊栏目: 作物营养、栽培与遗传育种
• 页码范围: 478-484
• 页数: 7页
• 分类号: S511.901
• 字数: 3876字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2561.2008.04.016

摘要

以转bar基因粳稻(O.astiva ssp.japonica)YOO3为外类群,采用PAUP4.0等软件,对海南7个主要普通野生稻(O.rufipogon)核糖体基因(nrDNA)的内转录间隔区(ITS)全序列信息进行比较分析.结果表明,ITS全长为586～589 bp,其中ITS1为193～195 bp,共有20个变异位点数,G/C含量为72.02%～74.74%;ITS2为229～231 bp,共有12个变异位点数,G/C含量为75.55%～76.08%:离栽培稻越近的类群G/C含量越高.所有材料5.8S rDNA序列完全一致,全长164 bp,G/C占97 bp,含量为59.15%.各类群间ITS序列信息较丰富,且显示ITS1比ITS2进化速度要快.利用ITS差异信息序列进行聚类分析为鉴别不同居群的普通野生稻提供了分子依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	孔华	中国热带农业科学院热带生物技术研究所	37	330	9.0	16.0
2	郭安平	中国热带农业科学院热带生物技术研究所	81	763	15.0	23.0
3	彭于发	中国农业科学院植物保护研究所	54	1206	20.0	33.0
4	刘恩平	中国热带农业科学院热带生物技术研究所	52	338	9.0	16.0
5	贺立卡	中国热带农业科学院热带生物技术研究所	28	320	9.0	17.0
6	王晓玲	中国热带农业科学院热带生物技术研究所	2	10	2.0	2.0
7	林海妹	中国热带农业科学院热带生物技术研究所	6	17	2.0	4.0