对69个钦州湾牡蛎个体的线粒体DNA 16 S rRNA进行PCR扩增,纯化后的PCR产物测序分析,研究16 S rRNA基因在白肉牡蛎和红肉牡蛎2个群体中的遗传多样性,通过DNAman比对序列并构建系统进化树.结果得到2个群体的序列长度均为434 bp,共检测到16个核苷酸突变位点,包括8个转换位点和8个颠换位点.与GenBank序列比对发现,白肉牡蛎和香港牡蛎的序列基本相同,系统进化树中显示白肉牡蛎与香港牡蛎聚为一支,红肉牡蛎与有明巨牡蛎聚为一支.证实了白肉牡蛎和红肉牡蛎是2个不同的种,它们有各自的遗传多样性,该研究为牡蛎的遗传育种提供科学依据.