基因芯片分析亚洲人胰腺癌细胞株纯合性缺失

• 作者: 刘香 林艳 林连捷 胡刚正 郑长青 金玉
• 来源期刊: 中国现代医学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 单核苷酸多态性 基因芯片 胰腺癌 纯合性缺失
• 年，卷（期）: 2008,（11）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 1511-1513
• 页数: 3页
• 分类号: R735.9
• 字数: 2185字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1005-8982.2008.11.011

摘要

目的 为了探索亚洲人种胰腺癌癌变过程中的基因异常,研究亚洲人胰腺癌基因组的纯合性缺失.方法 应用高密度的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)芯片,检测8种亚洲人胰腺癌细胞株基因组的纯合性缺失,并应用分析软件进行数据分析,用PCR验证纯合性缺失住点.结果 8种亚洲人胰腺癌细胞基因组中,发现34个纯合性缺失区域,其中26个区域是编码区,8个区域为非编码区.筛选可能与胰腺癌发生和发展有关的15个编码区,经PCK验证其中12个区域确实为纯合性缺失,芯片的准确度为80%,其中最小缺失区域为0.3kb.染色体9p21.3为缺失频率最高的区域.结论 应用高解析度的SNP芯片,可以检测全基因组范围内的胰腺癌纯合性缺失,筛查到很小的缺失位点.这些纯合性缺失区域可能含有新抑癌基因,为今后胰腺癌的研究提供了新的线索和方向.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	郑长青	中国医科大学附属盛京医院消化内科	109	1169	19.0	30.0
2	胡刚正	中国医科大学附属盛京医院消化内科	13	222	10.0	13.0
3	林艳	中国医科大学附属盛京医院消化内科	38	238	7.0	15.0
4	金玉	中国医科大学附属盛京医院消化内科	18	71	5.0	8.0
5	刘香	中国医科大学附属盛京医院消化内科	39	194	9.0	12.0
6	林连捷	中国医科大学附属盛京医院消化内科	61	475	11.0	20.0