基于最小自由能的DNA编码设计算法

• 作者: 张凯 强小利 耿修堂 肖建华
• 来源期刊: 武汉理工大学学报（信息与管理工程版）
• 学科: 工学
• 关键词: DNA计算 最小自由能 DNA二级结构 DNA编码设计
• 年，卷（期）: 2008,（2）
• 所属期刊栏目: 学术论文
• 页码范围: 176-179
• 页数: 4页
• 分类号: TP301.5
• 字数: 2638字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3963/j.issn.1007-144X.2008.02.003

摘要

为了提高DNA计算的有效性和可靠性,提出了一种启发式的全局搜索DNA编码算法.算法生成一组等长的DNA序列,这组DNA序列满足统一的解链温度约束和最小自由能约束.通过枚举所有可能的DNA杂交的二级结构,根据Nearest-Neighbors热力学模型计算出这些组合结构的最小自由能,可极大地提高DNA序列自由能的计算精度.该算法比传统基于汉明距离的DNA编码算法设计的DNA序列具有更好的稳定性和可靠性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张凯	华中科技大学控制科学与工程系	81	1621	19.0	38.0
2	强小利	华中科技大学控制科学与工程系	5	111	4.0	5.0
3	肖建华	华中科技大学控制科学与工程系	8	58	4.0	7.0
4	耿修堂	华中科技大学控制科学与工程系	6	33	3.0	5.0