人糖皮质激素受体调控靶基因的生物信息学分析

• 作者: 严军 周建云 曾灵 王海燕 蒋建新 顾玮
• 来源期刊: 基础医学与临床
• 学科: 医学
• 关键词: 糖皮质激素 糖皮质激素受体 糖皮质激素反应元件 GRE的保守序列 生物信息学
• 年，卷（期）: 2008,（11）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 1146-1150
• 页数: 5页
• 分类号: R318.04
• 字数: 1928字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-6325.2008.11.007

摘要

目的 分析糖皮质激素受体(GR)靶基因在人类基因组的分布及功能,明确其生物学意义.方法 通过生物信息学的方法,在人类基因组中找出所有含有糖皮质激素反应元件(GRE)保守序列的基因.通过NCBI的基因注释得到基因名称、功能、基因的蛋白产物及其对廊的基因本体学(Gene Ontology,GO)号等,然后对这些基因的功能进行GO分类,最后重点分析这些基因在免疫、炎症反应中的作用.结果 含有GRE-1保守序列(5'-AGAACAnnnTGTTCT-3')的基因共有225个,其中有18个位于基因启动子区域,10个位于基因外显子区域,197个位于内含子区域;含有GRE-2保守序列的基因有94个,其中有13个位于基因启动子区域,5个位于基因外显子区域,76个位于内含子区域.结论 含有GRE的基因中F2R、DAXX、PAG1、ULBP3、OR8D4、RIMS1、NPY2R与激素代谢、免疫以及应激响应相关.