分子遗传学数据分析和处理平台的设计与实现

• 作者: 刘娜 王胜军 邓亲恺 郭云波 闫微
• 来源期刊: 热带医学杂志
• 学科: 生物学
• 关键词: SNPs 遗传变异 关联分析 群体遗传 生物信息学
• 年，卷（期）: 2008,（3）
• 所属期刊栏目: 硕博专栏论著
• 页码范围: 225-228
• 页数: 4页
• 分类号: Q811.4
• 字数: 2460字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-3619.2008.03.011

摘要

目的 开发一个在高性能计算机的Linux环境下运行,基于B/S模式的分子遗传学数据分析与处理平台.方法 以Apache HTTP服务器为平台的WEB服务器,采用Perl语言整合许多遗传学数据分析软件和工具包,针对不同的SNPs变异数据,以提示方式简化数据输入格式和参数设置,经平台处理的结果以表格、文本或图像格式输出.结果 该平台实现了连锁不平衡的计算和绘制、挑选标签SNP和疾病对照设计或传递不平衡设计的关联分析,以及对一些群体遗传数据的估计等功能,操作简单,数据分析速度快.结论 该平台作为一个整合的遗传学研究辅助工具,克服了当前遗传分析软件或工具包在操作使用方面的不足,为遗传学研究者提供方便.目前该平台正处于测试阶级,运行状态良好.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	郭云波	南方医科大学基础医学院生物信息学研究室	16	33	3.0	4.0
2	邓亲恺	南方医科大学基础医学院生物信息学研究室	50	552	12.0	22.0
3	刘娜	南方医科大学基础医学院生物信息学研究室	8	21	3.0	4.0
4	王胜军	南方医科大学基础医学院生物信息学研究室	20	62	4.0	7.0
5	闫微	南方医科大学基础医学院生物信息学研究室	4	24	2.0	4.0