逐步预测和统计学筛选人H5N1毒株神经氨酸酶蛋白B细胞表位

• 作者: 俞守义 柯昌文 黄平
• 来源期刊: 科学通报
• 关键词: H5N1病毒 神经氨酸酶(NA) B细胞表位 预测 筛选
• 年，卷（期）: 2008,（22）
• 页码范围: 2748-2753
• 页数: 6页
• 语种: 中文

摘要

为了预测和筛选人禽流感H5N1毒株神经氨酸酶(NA)蛋白的B细胞表位,检测了人禽流感H5N1毒株NA基因核苷酸序列.采用Kyte-Doolittle的亲水性方案、Emini方案和Jameson-Wolf抗原指数方案,辅以对NA蛋白的二级结构中的柔性区域的分析,并用SPSS13.0进行聚类和相关分析,建立了一种统计学筛选程序,预测了H5N1病毒NA蛋白的B细胞表位,并对毒株GD-01-06的NA蛋白变异进行了分析.预测结果通过吴氏抗原指数和SWISS-MODEL软件进行评价.结果发现,预测并筛选最有可能的B细胞表位位于NA蛋白N端第120～137,81～84,408～415,273～282,429～432,356～368,46～55,146～155,341～350,198～209肽段,提示它们是B细胞表位的优势区段;含有糖基化位点NGT126～128的120～137肽段为首选的NA蛋白抗原表位;H5N1毒株NA蛋白第53位(Ⅰ)位点缺失,这有助于增加毒株GD-01-06的NA蛋白表面柔性,而且抗原表位扩大(VEP46～48→VEPISNTNFL46～55).采用SWISS-MODEL软件建立的N1蛋白模型有助于评价抗原表位预测.结果表明,用多参数预测以及用统计学筛选H5N1.毒株NA蛋白的B细胞表位,可以为分子免疫学研究和药物筛选提供依据;广东GD-01-06毒株NA蛋白53位(Ⅰ)位点缺失可能增强该抗原表位的抗原性.