栉孔扇贝急性病毒性坏死病毒荧光定量PCR检测方法的建立和应用

• 作者: 于佐安 任伟成 孙世春 李赟 王崇明 蔡玉勇
• 来源期刊: 中国水产科学
• 学科: 农学
• 关键词: 栉孔扇贝 AVNV AVND 荧光定量聚合酶链式反应(FQ-PcR) TaqMan探针
• 年，卷（期）: 2009,（4）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 564-571
• 页数: 8页
• 分类号: S94
• 字数: 5413字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1005-8737.2009.04.012

摘要

根据栉孔扇贝(Chlamys farreri)急性病毒性坏死病毒(Acute viral necmbiotic virus,AVNV)的基因序列,选择保守区段,应用Beacon Designer 7.0软件设计了一对能特异性扩增90 bp片段的引物和Taq Man探针,建立并完善了AVNV荧光定量聚合酶链式反应(Huorescent quantitative polymerase chain reaction,FQ-PCR)诊断方法.该方法在108～102病毒拷贝范围内有较好的线性关系,AVNV拷贝数(X)和循环数(G1)的相关关系为:IgX=-0.29C1+13.28(相关系数R2=0.998);检测AVNV的灵敏度为102拷贝;特异性实验表明只对AVNV基因组呈阳性反应.应用FQ-PCR对76份采自夏季发病期前后的栉孔扇贝样品进行检测,结果发现68份样品检测结果为阳性,阳性检出率为89.47%,高于普通PCR的阳性检出率(80.26%).研究结果表明,该方法快速、灵敏,特异、重复性良好且能实现AVNV的定量检测,对AVNV的快速诊断和分子流行病学的调查以及AVNV疫情监测具有重要意义.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李赟	中国海洋大学水产学院	48	532	14.0	20.0
2	孙世春	中国海洋大学水产学院	20	296	7.0	17.0
3	王崇明	中国水产科学研究院黄海水产研究所	30	428	12.0	20.0
4	于佐安		6	24	2.0	4.0
5	蔡玉勇	中国海洋大学水产学院	10	81	6.0	9.0
7	任伟成	中国海洋大学水产学院	6	54	5.0	6.0