猪繁殖与呼吸综合征病毒流行株Jiangxi-3的全基因组序列分析

• 作者: 宋长绪 张彩勤 张春红 杨增岐 王旭荣 赵炳武
• 来源期刊: 上海交通大学学报（农业科学版）
• 学科: 农学
• 关键词: 猪繁殖与呼吸综合征病毒 Jiangxi-3 全基因组 序列分析
• 年，卷（期）: 2009,（2）
• 页码范围: 101-107
• 页数: 7页
• 分类号: S852.651
• 字数: 5113字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1671-9964.2009.02.003

摘要

通过RT-PCR分段扩增PRRSV流行株Jiangxi-3的基因组,参照VR2332序列,根据各片段之间相重叠的区域,将扩增片段的序列依次拼接获得Jiangxi-3完整的全基因组,并通过DNAStar软件对其进行分析.结果表明:Jiangxi-3的Nsp2推导氨基酸发生30个氨基酸的不连续缺失,与HB-1(sh)/2002相比,Nsp2推导的第480位氨基酸由D突变为E,缺失的位置为第481位氨基酸和532～560位氨基酸;Jiangxi-3与2006年Tian Kegong等从江西"高热病"病死猪体内分离的毒株JXA1的各个结构蛋白阅读框的氨基酸同源性为98.0%～100%;Jiangxi-3与HB-1(sh)/2002、VR2332、RespPRRS MLV的Nsp2推导的氨基酸同源性分别为94.7%、77.8%、77.7%,由遗传系统发育树可知与2006年以前分离的毒株相比,Jiangxi-3与HB-1(sh)/2002的亲缘关系较近.说明Jiangxi-3和JXA1极可能由同一毒株HB-1(sh)/2002演化而来.