云南省猪圆环病毒的分子流行病学调查及其2型cap基因遗传多样性分析

• 作者: 叶丛华 吕粤 宋学林 岳亮 庞海洋 张富强 张应国 张文东 王瑞欣 田建国
• 来源期刊: 中国兽医科学
• 学科: 农学
• 关键词: 猪圆环病毒2型 cap基因 遗传多样性
• 年，卷（期）: 2009,（8）
• 所属期刊栏目: 病原生物学
• 页码范围: 690-695
• 页数: 6页
• 分类号: S852.659.2
• 字数: 4069字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1673-4696.2009.08.007

摘要

采用猪圆环病毒(PCV)通用PCR技术和PCV-2特异性PCR技术检测云南省2007～2008年采集的120份病猪组织样品,结果获得PCV-2阳性样品21份.选取12份有代表性的阳性样品进行cap基因的扩增、纯化,将产物克隆至pMD18-T载体测序,并与已知参考毒株进行比对及系统发育分析.结果显示,云南省12份阳性样品cap基因的核苷酸及氨基酸序列的同源性分别为92.4%～99.7%和94.4%～99.6%;与国内PCV-2毒株cap基因的核苷酸和氨基酸序列同源性为89.3%～92.9%、88.4%～94.0%;与国外毒株的核苷酸和氨基酸序列同源性为90.0%～99.4%、93.6%～99.6%.有25个氨基酸位点存在变异,其中14个位点位于抗原表位区;12份阳性样品可划分为3个进化分枝(1.1.1.1、1.1.2、1.2),其中1.1.2、1.2可能是新出现的分枝.