石斛属植物rbcL基因序列变异和系统发育初步研究

• 作者: 刘涛 张建勇 袁佐清
• 来源期刊: 时珍国医国药
• 学科: 医学
• 关键词: 石斛 rbcL基因 序列分析 系统发育
• 年，卷（期）: 2009,（7）
• 所属期刊栏目: 资源开发
• 页码范围: 1836-1837
• 页数: 2页
• 分类号: R2-03|R282.71
• 字数: 1820字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1008-0805.2009.07.147

摘要

目的 探讨10种石斛植物叶绿体rbcL基因序列变异和系统发育关系.方法 根据Genebank已经公布的植物rbcL基因序列设计一对引物,用于石斛rbcL基因PCR扩增.基因序列排列用Clustal X软件完成,应用Seqnconverter软件分析序列的长度、GC含量、GpC量、GCskew值等;用Mega 4.1软件分析转换值、颠换值、转换/颠换比;采用最大简约法(maximum parsimony method)获得最大简约系统树;应用自展法(bootstrap)检验系统树,自展次数为1 000次.结果 10种石斛植物叶绿体rbcL基因的长度范围为944～950 bp,其中536 bp为保守位点,466 bp为变异位点,439 bp为具有系统发育信息的信息位点.基因中GC含量为40.61%～41.37%,GpC含量为4.03%～4.78%,GCskew 值为0.043 2～0.082 1.序列转换/颠换比(Si/Sv)为0.9.结论 利用PCR和核酸测序方法可以获得rbcL基因的核苷酸序列,能为石斛植物的系统发育研究提供核苷酸序列方面的资料.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘涛	山东理工大学生命科学学院	29	261	9.0	15.0
2	张建勇	山东理工大学生命科学学院	16	192	8.0	13.0
3	袁佐清	山东理工大学生命科学学院	22	223	9.0	14.0