猪繁殖与呼吸综合征病毒强毒株HUB2株全基因组序列分析

• 作者: 候丽丽 孙明 张云霞 曹振 王斌 田克恭 赵铁柱 遇秀玲 邓小雨 陈西钊
• 来源期刊: 中国兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 猪繁殖与呼吸综合征病毒 全基因组 非结构蛋白 缺失
• 年，卷（期）: 2009,（12）
• 所属期刊栏目: 预防兽医学
• 页码范围: 1505-1510
• 页数: 6页
• 分类号: S852.65
• 语种: 中文

摘要

从湖北省暴发猪"高热病"的猪场分离出1株猪繁殖与呼吸综合征病毒(Porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV),并命名为HUB2株.根据GenBank上已发表的PRRSV全基因序列设计引物进行RTPCR扩增,获得PRRSV HUB2株全基因组cDNA序列.测序结果表明PRRSV HUB2株基因组全长15 320 bp(不包括PolyA尾).分析结果显示该毒株与PRRSV美洲型标准株(VR-2332)和欧洲型标准株(LV)全基因核苷酸同源性分别为89.6%和50.3%.说明HUB2属于美洲型毒株.与VR-2332相比,HUB2株非结构蛋白(Nsp2)存在2处不连续的缺失(共缺失30个氨基酸),其缺失位点位于推定氨基酸序列的第481位和532～560位.此次新出现的强毒株全基因组序列特性的揭示为科学防治猪高致病性蓝耳病奠定了理论基础.