鲤鱼品系的部分线粒体序列的遗传变异

• 作者: 匡友谊 孙效文 曹顶臣 赵莹莹
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 学科: 农学
• 关键词: 鲤 品系 16S rRNA Cytb D-loop
• 年，卷（期）: 2009,（1）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 59-66
• 页数: 8页
• 分类号: S188
• 字数: 1559字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2009.01.011

摘要

运用PCR测序法,以9个我国常见鲤鱼(Cyprinus carpio)养殖品种和2个野生群体为研究材料,分析线粒体DNA的16S rRNA、Cytb和D-loop序列片段,用于分析的序列共有1 457个位点,其中变异位点32个,简约信息位点21个,共有单倍型16个.分别利用以上3个基因片段以及合并后的序列,构建NJ和MP进化树.由不同方法获得相似的进化树,由不同基因片段得到的进化树均为两支,其中贝尔湖野鲤(BE)单独成支,其它群体聚为1支,只是由D-loop得到的进化关系更为详细.而由合并后的序列构建的进化树也与利用不同基因序列所得到的进化树并不矛盾.各品系间的分化时间约为3.03×104～1.21×105年前.根据序列的特征,16SrRNA的1个变异位点、Cytb基因的4个变异位点和D-loop的14个变异位点可以作为鉴定不同的养殖品系和野生群体的SNP,证明mtDNA序列分析可以应用于品系的鉴定.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	匡友谊	中国水产科学院黑龙江水产研究所	62	948	19.0	28.0
2	孙效文	中国水产科学院黑龙江水产研究所	159	3935	35.0	57.0
3	曹顶臣	中国水产科学院黑龙江水产研究所	66	800	14.0	25.0
4	赵莹莹	中国水产科学院黑龙江水产研究所	6	220	5.0	6.0