猪TAF7基因的克隆、染色体定位和组织表达谱分析

• 作者: 储明星 唐中林 崔文涛 张兴举 李奎 杨述林 牟玉莲 王志伟 马月辉
• 来源期刊: 中国农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 猪TAF7基因 克隆 基因定位 组织表达谱
• 年，卷（期）: 2009,（1）
• 所属期刊栏目: 畜牧·资源昆虫
• 页码范围: 267-273
• 页数: 7页
• 分类号: S8
• 字数: 5065字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3864/j.issn.0578-1752.2009.01.034

摘要

[目的]通过对猪TAF7基因初步的研究,为猪分子遗传育种提供基础分子生物学信息,为猪的遗传育种提供分子标记.[方法]以五指山猪为研究对象,克隆TAF7基因,分析该基因结构特点,然后利用IMpRH(theINRA-Universny of Minnesota poreine radiation hybrid,法国农业科学院-明尼苏达大学的辐射杂种克隆板)分析该基因在猪染色体上定位信息,利用半定量RT-PCR方法,分析该基因在成年五指山猪16个不同组织(心脏、背肌、淋巴、脾脏、肝脏、肾脏、肺脏、子宫、睾丸、胃、小肠、大肠、卵巢、胸腺、脑、脂肪)的表达谱信息.[结果]克隆得到长1 701 bp的五指山猪TAF7基因序列,其中包括1 050 bp完整CDS(Coding Sequence,编码序列)区域,分析表明其编码含349个氨基酸的蛋白质.利用IMpRH分析结果表明,猪TAF7基因与分子标记SW1879和IL4(intorleukin-4,白细胞介素-4)紧密连锁,LOD(Limit of Detection,检测极限)值分别为6.69和6.15.组织表达谱分析结果显示该基因在大多数组织中均有表达,其中在睾丸表达量较高,而在心脏、背肌中表达很低.[结论]猪TAF7基因5'UTR中有一个短的内含子,而在该基因CDS区域没有内含子.猪TAF7蛋白序列与人TAF7蛋白序列的相似性较高,二者在生物系统发育树中的距离最接近.猪TAF7基因在大多数组织中均表达,在猪睾丸中表达量较高,证实它调节目的基因转录具有广泛性.