南方红豆杉紫杉烷7β-羟基化酶基因全长序列的克隆和进化分析

• 作者: 燕丽娜 王艇 苏应娟
• 来源期刊: 中山大学学报（自然科学版）
• 学科: 生物学
• 关键词: 南方红豆杉 紫杉烷7β-羟基化酶基因 正选择 负选择
• 年，卷（期）: 2009,（5）
• 页码范围: 120-124,130
• 页数: 6页
• 分类号: Q349
• 字数: 4472字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0529-6579.2009.05.024

摘要

从南方红豆杉Taxus wallichiana var.mairei的新鲜嫩叶中提取基因组DNA作为模板,利用三组特异引物进行PCR扩增,然后克隆测序得到紫杉烷7β-羟基化酶的基因全长.该基因编码区起始密码子为ATG,终止密码子为TGA,全长1 692 bp;碱基组成为490 A (29.0%),351 C (20.7%),362 G (21.4%)和489 T (28.9%).将紫杉烷7β-羟基化酶基因全长序列与细胞色素P450基因家族的其它三个成员进行比对,发现它与紫杉烷2α-羟基化酶基因、紫杉烷10β-羟基化酶基因及紫杉烷13α-羟基化酶基因的一致性分别为74%、68%及76%.它们的外显子和内含子的连接区均具保守的GT-AG结构,内含子区的变异性明显高于外显子区.进一步以红豆杉属的13个紫杉烷羟基化酶基因家族成员为对象,利用位点间可变ω(非同义替换率dN和同义替换率dS的比值) 模型对该基因家族的适应性进化进行分析.分支模型、位点模型以及分支-位点模型的分析表明:紫杉烷羟基化酶基因家族的少数分支处于正选择压力下(ω>1),但未检测到正选择位点;而绝大部分位点受强烈的负选择作用(ω<1).

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	苏应娟	中山大学生命科学学院	48	804	18.0	27.0