激光捕获显微切割联合SELDI蛋白质芯片筛选肺腺癌早期诊断标志蛋白

• 作者: 余捷凯 南岩东 张潍 杨拴盈 田应选 郑树
• 来源期刊: 四川大学学报（医学版）
• 学科: 医学
• 关键词: 激光捕获显微切割 表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱 蛋白质组学 肺腺癌 早期诊断
• 年，卷（期）: 2009,（1）
• 所属期刊栏目: 技术与方法
• 页码范围: 157-161
• 页数: 5页
• 分类号: R734.2
• 字数: 3276字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-173X.2009.01.038

摘要

目的 探讨应用激光显微切割(LCM)联合表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱蛋白质芯片(SEL,DI-TOF-MS)及模式识别分类技术-支持向量机(SVM)筛选肺腺癌标志蛋白的可行性.方法 将6例新鲜肺腺癌组织标本及其配对的4例正常肺组织制备8μm厚度冰冻切片,改良HE染色;用LCM技术选择性获取同质腺癌细胞和配对正常肺组织细胞.应用PBSⅡ+型SELDI-TOF-MS分析仪(IMAC芯片)分析腺癌及其配对正常细胞的蛋白质表达谱,比对差异点;应用SVM筛选并验证候选标志蛋白的判别效能.结果 平均每个LCM帽子的激光点数约4000 shots,获得了同质性>95%的肿瘤细胞和正常细胞.比较腺癌和配对正常细胞之间的SELDI谱图,共筛选出84个蛋白峰.将差异最明显的10个蛋白峰作为候选标志蛋白.和正常组织相比,6种蛋白在腺癌中呈低表达,4种蛋白在腺癌中呈高表达.差异有统计学意义(P<0.05).初步筛选出3191 m/z蛋白峰作为腺癌诊断标志蛋白.结论 LCM联合SEIDI蛋白质芯片技术有可能筛选出敏感性高、特异性强的肺腺癌标志蛋白;该技术将为肺腺癌早期诊断研究提供新的强有力的工具.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	郑树	浙江大学医学院附属第二医院肿瘤研究所	227	2645	27.0	42.0
2	杨拴盈	西安交通大学医学院第二附属医院呼吸科	72	472	10.0	19.0
3	余捷凯	浙江大学医学院附属第二医院肿瘤研究所	44	344	9.0	17.0
4	张潍	西安交通大学医学院第二附属医院呼吸科	38	184	8.0	12.0
5	田应选	西安交通大学医学院第二附属医院呼吸科	24	77	6.0	7.0
6	南岩东	西安交通大学医学院第二附属医院呼吸科	8	64	6.0	8.0