结直肠癌患者粪便细菌实时荧光定量PCR标准品制备方法的比较研究

• 作者: 包维民 王昆华 邵剑春 郭世奎 陈弟 龚昆梅
• 来源期刊: 中国现代普通外科进展
• 学科: 医学
• 关键词: 结直肠肿瘤 粪便 细菌 实时荧光定量PCR
• 年，卷（期）: 2009,（11）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 939-942
• 页数: 4页
• 分类号: R735.3+5
• 字数: 3414字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1009-9905.2009.11.006

摘要

目的:比较结直肠癌患者粪便细菌实时荧光定量PCR标准品制备方法的优缺点及获得DNA的质与量.方法:以粪肠球菌作为试验菌株,分别采用标准菌株法、PCR扩增产物纯化法和PCR扩增目的片段割胶纯化法制备标准品,比较三者用于细菌实时荧光定量PCR标准曲线制作的好坏及用核酸蛋白检测仪Biophotmeter测定获得DNA的质与量.并将PCR扩增产物纯化法得到的产物进行测序.结果:PCR扩增目的片段割胶纯化法获得DNA的量及纯度均较低,为29.9±3.2和2.8±0.2,标准菌株法和PCR扩增产物纯化法的量及纯度均较高,分别为62.9±2.7及1.7±0.1,59.1±2.7及1.8±0.1;PCR扩增目的片段割胶纯化法与标准菌株法和PCR扩增产物纯化法相比,差异有统计学意义(P<0.05),标准菌株法和PCR扩增产物纯化法相比,差异无统计学意义(P>0.05),但以标准菌株法为佳.采用标准菌株法及PCR扩增产物纯化法,能获得很好的标准曲线(r=-1.00).并且纯化产物序列与目的片段序列完全相同.结论:标准菌株法及PCR扩增产物纯化法制备标准品作荧光定量PCR检测比PCR扩增目的片段割胶纯化法更适合肠道相关分子微生态的研究.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	邵剑春	昆明市第一人民医院检验科	25	157	6.0	11.0
2	陈弟	昆明市第一人民医院检验科	2	24	2.0	2.0