铜绿假单胞菌PAO1株基因组中2个SOS盒序列的初步鉴定

• 作者: 何晓梅 光丽霞 周世文 张克斌 张国斌 盛哈雷 钱桂生
• 来源期刊: 第三军医大学学报
• 学科: 医学
• 关键词: 铜绿假单胞菌PAO1株 SOS盒 LexA蛋白 回文序列 凝胶滞后实验 DNase Ⅰ足纹法
• 年，卷（期）: 2009,（11）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 1032-1036
• 页数: 5页
• 分类号: Q503|Q755|R378.991
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1000-5404.2009.11.011

摘要

目的 鉴定铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa,PA)PAO1株基因组中的SOS盒序列.方法 挑选铜绿假单胞菌PAO1株基因组中16个可能含有SOS盒序列的DNA片段,经PCR扩增后,用纯化的LexA表达蛋白做凝胶滞后实验;将获得的2个阳性DNA片段进一步用DNase Ⅰ足纹法进行LexA蛋白结合序列即SOS盒的鉴定;分析所获得的2个SOS盒中的回文序列,以此回文序列在PAO1基因组中进行检索,初步分析出可能的SOS盒序列和可能的调控基因.结果 通过DNase Ⅰ足纹法初步鉴定了PAO1基因组中2个SOS盒序列,即位于基因组4 052 647～4 052 662 bp位置的CTGTCTACTFATACAG序列和5 349 888～5 349 903 bp位置的CTGTATAAATAACCAC序列,分析其回文结构为"CTG…CAG",以此回文序列在基因组中进行检索,共获得了10个候选的SOS盒序列.结论 初步证实了PAO1基因组中的2个SOS盒,并获得了10条SOS盒候选序列.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	钱桂生		591	5662	33.0	52.0
4	光丽霞	第三军医大学新桥医院医学实验技术中心	18	49	3.0	6.0
5	张克斌	第三军医大学新桥医院医学实验技术中心	29	184	7.0	13.0
6	周世文	第三军医大学新桥医院医学实验技术中心	32	375	9.0	18.0
7	何晓梅	第三军医大学新桥医院医学实验技术中心	9	30	3.0	5.0
14	盛哈雷	第三军医大学新桥医院医学实验技术中心	1	0	0.0	0.0
15	张国斌	第三军医大学新桥医院医学实验技术中心	3	26	2.0	3.0