利用基因芯片探讨五氯酚发育毒性的作用机制

• 作者: 吴兆毅 尹大强 胡平 赵庆顺
• 来源期刊: 环境科学
• 学科: 地球科学
• 关键词: 五氯酚 斑马鱼 基因芯片 发育毒性 生物信息学
• 年，卷（期）: 2009,（11）
• 页码范围: 3382-3387
• 页数: 6页
• 分类号: X171.5
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0250-3301.2009.11.042

摘要

0hpf斑马鱼胚胎经50 μg/L五氯酚(PCP)暴露染毒8 h,提取其总RNA,与Affymetrix公司的斑马鱼基因组芯片杂交.发现与对照组相比,染毒样本中1149个基因的表达显著增强(Signal log ratio>1),501个基因的表达显著减弱(Signal log ratio<-1).利用Chipinfo、Cenmapp等生物信息学软件对差异表达基因进行了基因本体论功能分类和发育调控通路分析,结果显示,显著差异表达的基因涉及抗氧化、信号传导、翻译调节、转录调节等多个分子功能.五氯酚暴露后斑马鱼胚胎发育重要的调控通路BMP信号、ERK通路、FGF信号、Nodal信号的调控基因smad2、smad5、6mp4、6mp7、flh、n-ras的表达发生了显著变化,Signal log ratio分别为4.6、2.1、1.6、1.0、1.3、1.0.这些结果为进一步阐明五氯酚的发育毒性作用机制提供了标志物.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赵庆顺	南京大学模式动物研究所	17	85	6.0	8.0
2	尹大强	南京大学环境学院污染控制与资源化研究国家重点实验室	39	2229	23.0	39.0
6	胡平	南京大学模式动物研究所	6	48	5.0	6.0
7	吴兆毅	南京大学环境学院污染控制与资源化研究国家重点实验室	3	27	3.0	3.0