绵羊痘病毒ORFl21基因的序列分析及其B细胞表位预测

• 作者: 乔自林 刘俊林 王明明 郑亚东 陆会宁 陈智华 陈轶霞
• 来源期刊: 黑龙江畜牧兽医
• 学科: 农学
• 关键词: 绵羊痘病毒 ORFl21 序列分析 B细胞表位
• 年，卷（期）: 2009,（2）
• 所属期刊栏目: 实验研究
• 页码范围: 16-18
• 页数: 3页
• 分类号: S852.65+4
• 字数: 2213字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1004-7034.2009.02.006

摘要

选取GenBank上4株不同绵羊痘毒株ORF121基因序列,采用DNASTAR软件对该基因序列进行同源性分析,并以B细胞表位分析参数及蛋白质二级结构分析数据,综合预测ORFl21蛋白B细胞表位.结果表明:4株不同绵羊痘毒株ORF121基因核苷酸序列的同源性为99%;在ORFl21蛋白的肽链中,35～46、76～82、160～167区段亲水性强,35～45、54～83、90～124、130～139、144～158和160～167区段柔韧性好,37～45、112～116、129～137和143～167区段抗原指数高,33～45、78～83和159～167区段表面可及性高,30～57和151～170区段可形成一定的空间构象.结果说明ORF121基因在不同的绵羊痘病毒流行株之间非常保守,ORF121蛋白35～45、160～167区段可能是B细胞表位优势区.具有潜在的疫苗或/和诊断价值.