中国部分地区2005-2007年猪繁殖与呼吸综合征病毒分离株ORF5基因和Nsp2基因遗传变异分析

• 作者: 刘湘涛 张彦明 薛青红 邓永 邹敏 郎洪武 高金源
• 来源期刊: 中国农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 猪繁殖与呼吸综合征病毒 病毒分离 ORF5基因 Nsp2基因 遗传变异
• 年，卷（期）: 2009,（5）
• 所属期刊栏目: 兽医
• 页码范围: 1805-1812
• 页数: 8页
• 分类号: S8
• 语种: 中文
• DOI: 10.3864/j.issn.0578-1752.2009.05.038

摘要

[目的]为分析2005-2007年间中国部分省区猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)流行毒株的分子生物学特征,了解其遗传演化规律,查明中国目前PRRSV流行毒株现状.[方法]应用病毒分离方法从中国4个省份在2005-2007年间采集的81份疑似蓝耳病病料中分离到36株猪繁殖与呼吸综合征病毒,应用RT-PCR方法对36株PRRSV现地分离株的ORF5基因和Nsp2基因进行扩增和序列分析.[结果]36株现地分离株均属于美洲型PRRSV,0RF5基因全长均为603 bp,未发现有基因缺失或插入,编码约200个氨基酸,分离株推导氨基酸序列变异主要发生在9～39位;36个分离株中有1 5株PRRSV Nsp2基因全长为2 940 bp,21株PRRSV Nsp2基因全长为2 850 bp;发生Nsp2缺失的PRRSV在Nsp2基因第481位、532～560位发生了不连续缺失,共缺失30个氨基酸.与GeneBank中收录的14个PRRSV 0RF5、Nsp2基因进行核苷酸及氨基酸序列比较和分析,系统进化关系显示,除B02-2005株可能与疫苗株有关外,多数现地分离株与Ch-la株遗传距离较近,不同年份分离到的毒株与早期PRRSV分离株的同源性逐年降低.[结论]根据氨基酸变异情况对PRRSV现地分离株进行亚群聚类分析,发现36株现地分离株分别归属于以VR-2332为代表的4亚群,以BJ-4为代表的1亚群和以Ch-la为代表的2亚群.进化关系表明PRRSV ORF5、Nsp2基因及其推导的氨基酸序列均发生了较大变异,不同地区PRRSV分离株的遗传关系存在交叉现象,地域特征不明显.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张彦明	西北农林科技大学动物医学院	256	1530	16.0	24.0
2	刘湘涛	中国农业科学院兰州兽医研究所	86	606	14.0	22.0
3	邓永		27	149	6.0	11.0
4	薛青红	西北农林科技大学动物医学院	21	134	6.0	11.0
6	郎洪武		30	205	8.0	13.0
7	高金源		19	80	5.0	8.0
8	邹敏		16	75	5.0	8.0