草本纤维提取用菌株的PCR-16S rDNA及ITS-RFLP分析

• 作者: 冯湘沅 刘正初 成莉凤 段盛文 郑科 郭刚
• 来源期刊: 湖北农业科学
• 学科: 生物学
• 关键词: 草本纤维 产芽孢菌株 PCR-16S rDNA ITS-RFLP
• 年，卷（期）: 2009,（9）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 2052-2054,2098
• 页数: 4页
• 分类号: Q939.124|Q789
• 字数: 2314字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.0439-8114.2009.09.002

摘要

通过分析从沤麻水中分离到的8株草本纤维提取用菌株的16S rDNA以及ITS序列,鉴定并构建其聚类图,明确草本纤维提取用菌株的遗传关系.通过BLAST比对16S rDNA并用限制性内切酶酶切16～23S的ITS保守序列,对参试菌株的16S rDNA及ITS酶切片段进行聚类分析.结果表明,8株菌株分别属于地表芽孢杆菌、梭状芽孢杆菌、蜡状芽孢杆菌、短小芽孢杆菌、枯草芽孢杆菌以及多粘类芽孢杆菌:基于16S rDNA序列与ITS-RFLP所获得的聚类结果基本一致,菌株1251与菌株1172-1聚为一类,其余聚为一类,但种内聚类存在一定的差异,可能与不同类型的序列进化程度有关,8株菌株的16SrDNA序列的相似性为78.66%;Alu Ⅰ、Hinf Ⅰ、Sau3A Ⅰ、Taq Ⅰ 4种限制性内切酶对参试的8株草本纤维提取用产芽孢菌株的ITS进行酶切,各获得0～4条100～440bp的酶切产物.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘正初	中国农业科学院麻类研究所	68	454	11.0	16.0
2	冯湘沅	中国农业科学院麻类研究所	44	278	9.0	14.0
3	郑科	中国农业科学院麻类研究所	50	301	9.0	14.0
4	段盛文	中国农业科学院麻类研究所	42	231	9.0	13.0
5	郭刚	中国农业科学院麻类研究所	10	8	2.0	2.0
6	成莉凤	中国农业科学院麻类研究所	32	91	6.0	7.0