使用16S rDNA序列分析鉴定副溶血性弧菌

• 作者: 吴文娟 周晓明 姜婷 张继伦 王宏萍 鲍依稀
• 来源期刊: 中国卫生检验杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 16S rDNA分析 副溶血性弧菌 临床菌株
• 年，卷（期）: 2009,（9）
• 所属期刊栏目: 微生物检测方法
• 页码范围: 2034-2036,2094
• 页数: 4页
• 分类号: R378.3
• 语种: 中文

摘要

目的:测试应用16S rDNA序列分析鉴定副溶血性弧菌的适用性.方法:用16S rDNA基因的扩增引物,对从腹泻者、水产品和环境中分离获得的副溶血性弧菌(n=39)及临床分离的15种(n=181)常见菌的基因组DNA进行聚合酶链反应,产物经琼脂糖凝胶电泳纯化后直接测序.序列通过blastn,在GenBank中比对,确定细菌属种并与表型法结果进行比较.结果:220株菌(220/220)扩增出870 bp的目的片段,平均测序长度752 bp.36/39株副溶血性弧菌鉴定结果与生化培养法相符,3株菌株分别鉴定为科氏葡萄球菌(Staphylococcus cohnii),表皮葡萄球菌(Staphylococcus epidermidis)和Oceanobacillus profundus.181株其它临床分离菌无误判为副溶血性弧菌,其中123株与生化培养法结果一致,58株有差异.结论:本文报告的16S rDNA基因序列分析可用于准确鉴定副溶血性弧菌,并可与15种临床常见分离菌区分.