用于SSR分析的大豆干种子DNA提取条件的优化

• 作者: 姚丹 张扬 张迪 曲静 王丕武
• 来源期刊: 安徽农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 大豆 干种子 基因组DNA 提取
• 年，卷（期）: 2009,（23）
• 所属期刊栏目: 农业生物技术
• 页码范围: 10917-10921
• 页数: 5页
• 分类号: S565.1
• 字数: 5227字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.0517-6611.2009.23.036

摘要

[目的] 探讨适于SSR分析的大豆干种子DNA提取的最佳方法.[方法] 以2个大豆品种的干种子为材料, 分别采用改良SDS法和CTAB法提取大豆基因组DNA, 用1%琼脂糖凝胶电泳检测DNA质量,用紫外分光光度计分别测定其DNA在A230、A260和A280下的吸光值,根据A260/A230和A260/A280的比值检测DNA的纯度和浓度,并分别以两种DNA为模版进行SSR-PCR扩增.[结果] 相同DNA提取条件下,SDS法提取DNA样品的纯度和浓度均高于CTAB法,SDS终浓度为2%(W/V),水浴15 min,氯仿/异戊醇抽提2次时所提取大豆种子DNA的纯度及浓度最高,其DNA的OD260/OD280值为1.86,SDS法所提的DNA泳带分布较集中,无拖尾现象,其DNA浓度能够满足SSR扩增模板的需求.[结论] SDS浓度为2%(W/V),水浴15 min,氯仿/ 异戊醇抽提2次时提取大豆干种子DNA的浓度和纯度都较高,可以满足后续的各种分子生物学操作的要求.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	姚丹		88	473	12.0	16.0
2	张扬		4	25	3.0	4.0
3	曲静		73	262	8.0	11.0
4	张迪		9	19	3.0	3.0
5	王丕武		249	1853	20.0	32.0