Actin,干旱胁迫条件下相对可靠的内部参照基因

• 作者: 余灿 刘东华 张家亮 曹金华 王直华 靳德明
• 来源期刊: 生物学杂志
• 学科: 生物学
• 关键词: 干旱胁迫 基因表达 actin 管家基因 实时定量PCR
• 年，卷（期）: 2010,（3）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 13-16,19
• 分类号: Q786
• 字数: 4160字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1008-9632.2010.03.013

摘要

很多关于干旱胁迫机制的研究涉及目标基因的差异表达,实时定量PCR技术在探测目标mRNA的变化方面是最为敏感的.为了避免偏差,目标基因的表达常常需要参照一个或多个内标基因进行定量,内标基因一般是在不同的处理条件下表达相对稳定的管家基因,目前使用最多的是actin基因家族,但在不同处理条件下许多actin同源基因表达的相对稳定性并没有经过确认.很多研究表明:使用不合适的管家基因定量目标基因的表达,将对实验结果造成严重偏差,为了阐明该问题和选择最合适的参照基因,检测了在干旱胁迫条件下8个actin种内同源基因的表达稳定性,通过geNorm软件对其稳定性进行分析,发现在所选择的管家基因当中ACT(X16280)1的表达最稳定,而选择不稳定的actin基因作为内标,会严重影响对目标基因相对表达量的估计.因此,在研究干旱胁迫下目标基因的表达水平时,为了实验结果的准确性和可靠性,建议采用ACT(X16280)1或ACT(X16280)2作为内标.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	靳德明	华中农业大学植物科学技术学院	12	167	7.0	12.0
2	余灿	华中农业大学植物科学技术学院	3	12	2.0	3.0
3	王直华	华中农业大学植物科学技术学院	3	12	2.0	3.0
4	张家亮	华中农业大学植物科学技术学院	3	12	2.0	3.0
5	曹金华	华中农业大学植物科学技术学院	4	12	2.0	3.0
6	刘东华	华中农业大学植物科学技术学院	4	21	3.0	4.0