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盐胁迫条件下杨树bZIP转录因子全基因组分析
盐胁迫条件下杨树bZIP转录因子全基因组分析
作者:
党慧
孙赫
王升级
原文服务方:
山西农业大学学报(自然科学版)
杨树
转录因子
盐胁迫
生物信息
摘要:
[目的]杨树是三北地区重要的经济树种与绿化树种,然而其生长发育常受到干旱、盐碱等逆境胁迫的限制.为探明bZIP转录因子在杨树生长发育及抗逆胁迫过程中的分子生物学机制.[方法]本文利用生物信息学分析方法获得杨树bZIP转录因子214条,结合转录组测序数据,对其蛋白分子结构及盐胁迫条件下表达模式进行系统分析.[结果]根据其保守域氨基酸序列将214条杨树bZIP转录因子分为A、B、C、D、E、F、G、H、I、S及其他等11个亚族.盐胁迫处理后,14个杨树bZIP转录因子基因表达量显著上升,5个bZIP转录因子基因表达量显著下调,说明bZIP转录因子在杨树耐盐胁迫应答反应过程中发挥着重要的调节作用.[结论]该研究为以后该转录因子家族功能的深入研究利用提供理论基础.
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文献信息
篇名
盐胁迫条件下杨树bZIP转录因子全基因组分析
来源期刊
山西农业大学学报(自然科学版)
学科
关键词
杨树
转录因子
盐胁迫
生物信息
年,卷(期)
2018,(8)
所属期刊栏目
专栏:林业科学
研究方向
页码范围
1-7,14
页数
8页
分类号
S792.11
字数
语种
中文
DOI
10.13842/j.cnki.issn1671-8151.201804023
五维指标
作者信息
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姓名
单位
发文数
被引次数
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1
孙赫
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3.0
2
王升级
山西农业大学林学院
2
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3
党慧
山西农业大学林学院
1
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传播情况
被引次数趋势
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版权信息
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研究主题发展历程
节点文献
杨树
转录因子
盐胁迫
生物信息
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
山西农业大学学报(自然科学版)
主办单位:
山西农业大学
出版周期:
双月刊
ISSN:
1671-8151
CN:
14-1306/N
开本:
大16开
出版地:
邮发代号:
创刊时间:
1957-01-01
语种:
chi
出版文献量(篇)
2896
总下载数(次)
0
总被引数(次)
17521
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