SSAP逆转座子分子标记在柿属植物遗传分析中的应用

• 作者: 张青林 杜晓云 罗正荣 黄建民
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 学科: 农学
• 关键词: 柿属植物 种质鉴定 亲缘关系 逆转座子 特异序列扩增多态性(SSAP)
• 年，卷（期）: 2010,（4）
• 页码范围: 682-688
• 分类号: S6
• 字数: 3569字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2010.04.009

摘要

对SSAP(特异序列扩增多态性;sequence-specific amplification polymorphism)在部分柿属植物种质鉴定和亲缘关系分析中的应用进行了研究,并对每个SSAP引物单独用于柿属植物遗传分析的性能作了探讨.基于5个逆转座子引物的25对SSAP引物组合在供试28份柿属(Diospyros L.)基因型中共扩增出1 300个位点(多态位点93.38%),每对引物平均产生52个位点(含48个多态位点),表明SSAP是一种高多重比例系数(multiplex ratio)和高多态性的标记系统;经SSAP数据的UPGMA聚类和主坐标分析,原产中国、日本的柿种质(D.kaki Thunb.)及柿的近缘种各自单独成组,该聚类结果与部分已知亲缘关系的试材十分吻合,表明SSAP技术可用于柿属植物亲缘关系研究.此外,在25对SSAP引物组合中筛选出3对具高信息含量的引物组合,将在柿属植物遗传关系研究中广泛应用.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	罗正荣	华中农业大学园艺植物学教育部重点实验室	84	2004	30.0	43.0
2	张青林	华中农业大学园艺植物学教育部重点实验室	35	630	14.0	25.0
3	黄建民	江西省农业科学院园艺研究所	22	62	5.0	7.0
4	杜晓云	江西省农业科学院园艺研究所	5	30	3.0	5.0