花叶矢竹转录组中的转座子表达分析

• 作者: 刘静 周明兵 安苗苗 郦元
• 来源期刊: 浙江农林大学学报
• 关键词: 植物学 花叶矢竹 转座子 表达模式
• 年，卷（期）: 2016,（6）
• 页码范围: 935-943
• 页数: 9页
• 分类号: S722.3
• 语种: 中文
• DOI: 10.11833/j.issn.2095-0756.2016.06.003

摘要

以花叶矢竹Pseudosasa japonicaf.akebonosuji 10种不同颜色和不同发育阶段的叶片转录组数据为基础,调查了花叶矢竹中转座子的种类、数量以及选择性表达特性.结果表明:花叶矢竹转录组中转座子类型丰富、数量繁多,其中RNA转座子明显多于DNA转座子,转座子LTR/Copia类型数量最多.绿叶的5个发育阶段中,转座子主要在第5发育阶段高表达,表明这些转座子可能参与了花叶矢竹叶片成熟过程.而在白叶5个发育阶段中,转座子主要在第1发育阶段高表达;对绿叶和白叶5个相对应的发育阶段分析表明,白叶中高表达的转座子多于绿叶,表明这些转座子可能参与了花叶矢竹叶色变异过程,也可能是逆境胁迫导致转座子转座激活.