原文服务方: 浙江农林大学学报       
摘要:
长末端重复序列(LTR)反转录转座子广泛存在于植物基因组中,本质是一段可移动的脱氧核糖核酸(DNA)序列.大多数LTR反转录转座子在外界环境变化下能够被激活转录,对环境变化做出响应.为研究毛竹基因组中的LTR反转录转座子的转录活性及在非生物环境胁迫下表达量的具体变化,克隆和鉴定了1个毛竹Phyllostachys edulis反转录转座子PHRE7.该转座子全长为6073 bp,属于Ty1-copia家族中的Tork分支,LTR序列相似性为96.7%,插入时间为126.923万a前.对毛竹实生苗分别进行辐照(30,50,70 Gy),甲基化抑制剂(50,100,150μmol·L-1),高温(42℃),低温(4℃),高盐(0.1,0.2,0.3 mol·L-1)等5种不同胁迫处理,通过定量荧光聚合酶链式反应(PCR)检测,PHRE7在INT,RT和RH等3个结构域中的表达量仅在辐照及0.2~0.3 mol·L-1高盐处理下随处理强度的上升而下降,其余所有处理(甲基化抑制剂、 高温、 低温、 高盐0.1~0.2 mol·L-1)的表达量都随处理强度呈上升趋势.这些结果表明:PHRE7转座子是一个具有转录活性的LTR反转录转座子,且外界非生物环境胁迫对其表达模式有较大影响,表明PHRE7转座子能够响应外界环境变化.
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文献信息
篇名 毛竹Phyllostachys edulis retrotransposon 7(PHRE7)转座子的克隆与鉴定
来源期刊 浙江农林大学学报 学科
关键词 植物学 毛竹 LTR反转录转座子 生物信息学 逆境胁迫 转录活性
年,卷(期) 2019,(5) 所属期刊栏目
研究方向 页码范围 917-927
页数 11页 分类号 S718.3|S795.72
字数 语种 中文
DOI 10.11833/j.issn.2095-0756.2019.05.010
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 周明兵 浙江农林大学省部共建亚热带森林培育国家重点实验室 14 19 3.0 3.0
5 郑浩 浙江农林大学省部共建亚热带森林培育国家重点实验室 6 3 1.0 1.0
6 季航 浙江农林大学省部共建亚热带森林培育国家重点实验室 3 1 1.0 1.0
7 蒋政勤 浙江农林大学省部共建亚热带森林培育国家重点实验室 3 1 1.0 1.0
8 徐芷馨 浙江农林大学省部共建亚热带森林培育国家重点实验室 3 1 1.0 1.0
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植物学
毛竹
LTR反转录转座子
生物信息学
逆境胁迫
转录活性
研究起点
研究来源
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研究去脉
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期刊影响力
浙江农林大学学报
双月刊
2095-0756
33-1370/S
大16开
1984-01-01
chi
出版文献量(篇)
3071
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