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毛竹Phyllostachys edulis retrotransposon 7(PHRE7)转座子的克隆与鉴定
毛竹Phyllostachys edulis retrotransposon 7(PHRE7)转座子的克隆与鉴定
作者:
周明兵
季航
徐芷馨
蒋政勤
郑浩
原文服务方:
浙江农林大学学报
植物学
毛竹
LTR反转录转座子
生物信息学
逆境胁迫
转录活性
摘要:
长末端重复序列(LTR)反转录转座子广泛存在于植物基因组中,本质是一段可移动的脱氧核糖核酸(DNA)序列.大多数LTR反转录转座子在外界环境变化下能够被激活转录,对环境变化做出响应.为研究毛竹基因组中的LTR反转录转座子的转录活性及在非生物环境胁迫下表达量的具体变化,克隆和鉴定了1个毛竹Phyllostachys edulis反转录转座子PHRE7.该转座子全长为6073 bp,属于Ty1-copia家族中的Tork分支,LTR序列相似性为96.7%,插入时间为126.923万a前.对毛竹实生苗分别进行辐照(30,50,70 Gy),甲基化抑制剂(50,100,150μmol·L-1),高温(42℃),低温(4℃),高盐(0.1,0.2,0.3 mol·L-1)等5种不同胁迫处理,通过定量荧光聚合酶链式反应(PCR)检测,PHRE7在INT,RT和RH等3个结构域中的表达量仅在辐照及0.2~0.3 mol·L-1高盐处理下随处理强度的上升而下降,其余所有处理(甲基化抑制剂、 高温、 低温、 高盐0.1~0.2 mol·L-1)的表达量都随处理强度呈上升趋势.这些结果表明:PHRE7转座子是一个具有转录活性的LTR反转录转座子,且外界非生物环境胁迫对其表达模式有较大影响,表明PHRE7转座子能够响应外界环境变化.
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文献信息
篇名
毛竹Phyllostachys edulis retrotransposon 7(PHRE7)转座子的克隆与鉴定
来源期刊
浙江农林大学学报
学科
关键词
植物学
毛竹
LTR反转录转座子
生物信息学
逆境胁迫
转录活性
年,卷(期)
2019,(5)
所属期刊栏目
研究方向
页码范围
917-927
页数
11页
分类号
S718.3|S795.72
字数
语种
中文
DOI
10.11833/j.issn.2095-0756.2019.05.010
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
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1
周明兵
浙江农林大学省部共建亚热带森林培育国家重点实验室
14
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5
郑浩
浙江农林大学省部共建亚热带森林培育国家重点实验室
6
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季航
浙江农林大学省部共建亚热带森林培育国家重点实验室
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蒋政勤
浙江农林大学省部共建亚热带森林培育国家重点实验室
3
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徐芷馨
浙江农林大学省部共建亚热带森林培育国家重点实验室
3
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被引次数趋势
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版权信息
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引文网络
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逆境胁迫
转录活性
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
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期刊影响力
浙江农林大学学报
主办单位:
浙江农林大学
出版周期:
双月刊
ISSN:
2095-0756
CN:
33-1370/S
开本:
大16开
出版地:
邮发代号:
创刊时间:
1984-01-01
语种:
chi
出版文献量(篇)
3071
总下载数(次)
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