一个毛竹LTR转座子PHRE9的全长鉴定与转录活性分析

• 作者: 周明兵 季航 徐芷馨 蒋政勤 郑浩
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 学科: 农学
• 关键词: LTR反转录转座子 毛竹 顺式作用元件 胁迫 转录活性
• 年，卷（期）: 2019,（4）
• 所属期刊栏目: 研究论文与报告
• 页码范围: 645-655
• 页数: 11页
• 分类号: S718.4
• 字数: 7637字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2019.04.008

摘要

反转录转座子作为毛竹(Phyllostachys edulis)基因组中重要组成部分,可以通过自身转座参与毛竹生长发育的调控,获得具有活性的毛竹转座子,对竹子突变育种有着重要意义.本研究鉴定了1条结构完整的毛竹LTR反转录转座子PHRE9(Phyllostachys edulis retrotransposons 9),系统地分析了PHRE9结构特征和进化模式以及在逆境下的表达模式.通过对PHRE9转座子全长PCR扩增以及生物信息学分析,表明PHRE9全长为6 370 bp,属于Ty 1-copia大类中的Tork分支.利用qRT-PCR技术检测了在DNA甲基化抑制剂、辐照、高盐、高温、低温等不同处理条件下,PHRE9的3个结构域的基因转录活性水平.结果 表明在DNA甲基化抑制剂处理、辐照、高盐、高温(42℃)、低温(4℃)胁迫处理下PHRE9表达水平均有上调的现象,表现出转录激活特性.本研究为毛竹逆境适应机制研究以及竹子突变育种提供了基础资料.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	周明兵	浙江农林大学省部共建亚热带森林培育国家重点实验室	14	19	3.0	3.0
5	郑浩	浙江农林大学省部共建亚热带森林培育国家重点实验室	6	3	1.0	1.0
6	季航	浙江农林大学省部共建亚热带森林培育国家重点实验室	3	1	1.0	1.0
7	蒋政勤	浙江农林大学省部共建亚热带森林培育国家重点实验室	3	1	1.0	1.0
8	徐芷馨	浙江农林大学省部共建亚热带森林培育国家重点实验室	3	1	1.0	1.0