博来霉素致C57小鼠肺纤维化分子靶点的探寻

• 作者: 周文轩 王尉平 蒋小岗 郭次仪 顾振纶 黄冬冬
• 来源期刊: 苏州大学学报(医学版)
• 学科: 医学
• 关键词: 博来霉素 肺纤维化 差异表达基因 生物学通路 转录因子 小鼠
• 年，卷（期）: 2010,（2）
• 所属期刊栏目: 基础医学
• 页码范围: 260-264
• 分类号: R563.902
• 语种: 中文

摘要

目的 探寻博来霉素(BLM)致C57小鼠肺纤维化分子靶点.方法 应用BRB-ArrayTools软件中justRMA算法分析BLM(实验组)和生理盐水(对照组)作用于C57小鼠1、3、14 d后肺组织基因表达谱数据集GSE485,找出差异表达基因;应用DAVID在线工具对这些基因进行功能聚类,结合<京都基因与基因组百科全书>和BioCarta进行生物学通路分析;应用MSigDB搜寻[-2kb,2kb]区域富集的转录因子结合位点.结果 分别筛选出190、345、527个差异表达基因;按功能显著聚集的有趋化因子、膜蛋白、血清蛋白、补体成分、免疫球蛋白、钙黏蛋白、基质金属蛋白酶、前胶原类;受调控的有%11样受体、CCR5、ECM受体、补体途径、TGF-β生物学通路;富集度较高的有API、SRF、NFKAPPAB转录因子.结论 API、SRF和RhoA可能是BLM致C57小鼠肺纤维化的分子靶点.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	顾振纶		126	2275	28.0	41.0
5	周文轩		39	363	11.0	17.0
9	王尉平	苏州大学医学部生物化学与分子生物学系	27	154	8.0	12.0
10	蒋小岗		32	455	10.0	21.0
14	黄冬冬	苏州大学医学部生物化学与分子生物学系	1	0	0.0	0.0