长爪沙鼠线粒体DNA控制区全序列测定及分析

• 作者: 卢领群 戴方伟 李长龙 柯贤福 萨晓婴 郭红刚
• 来源期刊: 中国比较医学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 长爪沙鼠 D-loop区 序列测定 进化分析
• 年，卷（期）: 2010,（4）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 40-45
• 页数: 6页
• 分类号: R-33
• 字数: 4237字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1671-7856.2010.04.010

摘要

目的 对长爪沙鼠线粒体DNA控制区全序列进行测定,并对其进行鉴定及进化分析.方法 根据长爪沙鼠已知基因序列设计引物,采用PCR产物测序法,对所得的片段进行测序鉴定.结合已公布啮齿类动物D-loop区序列,分析其碱基组成、遗传距离、并基于最小进化法和UPGMA法构建系统进化树.结果 获得长爪沙鼠D-loop区序列,其与家鼠、小家鼠和仓鼠平均同源性为58%;碱基组成分析显示,长爪沙鼠与啮齿类动物有相似的碱基组成和碱基偏离,其A-skew和G-skew分别为0.0047和-0.28.进化分析结果 显示,长爪沙鼠与家鼠(0.35)、黑家鼠(0.38)和仓鼠(0.39)具有较近的遗传距离,其分化顺序为跳鼠、蔗鼠、长爪沙鼠、仓鼠、家鼠和小家鼠.结论 本研究获得长爪沙鼠D-loop区全序列,确定了长爪沙鼠与仓鼠、家鼠、小家鼠及其它啮齿动物的进化关系,为长爪沙鼠进化研究、线粒体的结构和功能研究奠定基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	萨晓婴	浙江省医学科学院浙江省实验动物中心	55	345	11.0	15.0
2	郭红刚	浙江省医学科学院浙江省实验动物中心	21	108	7.0	9.0
3	卢领群	浙江省医学科学院浙江省实验动物中心	21	136	7.0	11.0
4	戴方伟	浙江省医学科学院浙江省实验动物中心	29	87	5.0	7.0
5	柯贤福	浙江省医学科学院浙江省实验动物中心	26	105	6.0	8.0
6	李长龙	浙江省医学科学院浙江省实验动物中心	10	55	5.0	7.0