云南猕猴mtDNA控制区全序列测定

• 作者: 和占龙 杨凤梅 沈冬 王俊斌 禹文海 赵远 陈丽雄 鲁帅尧 黄芬
• 来源期刊: 中国比较医学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 猕猴 线粒体DNA 控制区 全序列
• 年，卷（期）: 2011,（12）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 42-45
• 分类号: R33
• 字数: 2374字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1671.7856.2011.12.011

摘要

目的 测定云南猕猴线粒体DNA控制区全序列,对其进行鉴定及进化分析.方法 利用PCR技术扩增猕猴线粒体DNA控制区全序列,结合GenBank中下载的猕猴参考序列(AY612638),采用多个生物学软件对序列碱基组成、同源性、转换/颠换比等遗传信息进行分析,并基于邻接法(NJ)和最小进化法(ME)构建系统进化树.结果 云南猕猴线粒体DNA控制区全长为(1 084～1 089) bp,A、T、G和C四种碱基平均含量分别为29.9％、26.9％、12.3％和30.9％,A+T含量(56.8％)高于G+C含量(43.2％).所分析序列间的同源性为91.5％～99.5％,平均核苷酸变异率为4.5％,变异类型包括转换、颠换、插入和缺失4种形式,转换/颠换比值平均为26.1.进化树显示云南猕猴存在两个平行进化的姐妹分支.结论 本研究获得了云南猕猴mtDNA控制区全序列,为猕猴进化关系研究及mtDNA控制区功能研究奠定基础.