OXA-72型β-内酰胺酶分子对接分析

• 作者: 秦玲 糜祖煌 翁幸鐾
• 来源期刊: 公共卫生与临床医学
• 学科: 医学
• 关键词: 分子对接 Β-内酰胺酶 Β-内酰胺类药物
• 年，卷（期）: ggwsylcyx,（2）
• 页码范围: 105-108
• 页数: 4页
• 分类号: R392.13

摘要

摘要：目的应用分子对接法分析OXA-72型β-内酰胺酶对底物β-内酰胺类药物水解活性。方法准备14种β-内酰胺类药物和β-内酰胺酶抑制剂棒酸的3D结构，其中头孢他啶、头孢噻肟由2D结构经过能量优化转化成3D，其余均为直接获得3D结构。随后将OXA-72型β-内酰胺酶基因序列翻译成氨基酸序列，并在SWISS-MODEL利用Brookhaven PDB数据库作同源建模，再使用ArgusLab4．1软件中的DOCK模块作14种β-内酰胺类药物和棒酸与OXA-72型β-内酰胺酶分子对接。结果Arguslab软件算得OXA-72型β-内酰胺酶的活性位点的氨基酸的ID号如下：80．84、127．134、218-224、258—261，由此构成酶活性口袋。结合自由能越低则酶催化效率越高，14种D．内酰胺类药物和棒酸与OXA-72型碳青霉烯酶对接的结合自由能最低为氯唑西林，最高为棒酸，即棒酸对β-内酰胺酶抑制弱，这与OXA类β-内酰胺酶活性不易被棒酸抑制相吻合。分子对接分析认为OXA-72型具有苯唑西林酶和碳青霉烯酶的功能，OXA-72型β-内酰胺酶与其它常见β-内酰胺酶分子进化分析显示OXA．72所属的OXA-24群和OXA-23群、OXA-51群、OXA-58群均属于碳青霉烯酶。结论随着计算机软硬件改进、模拟算法不断优化和结构生物信息学软件的推广，分子对接技术已悄然来到细菌耐药机制研究者的身边，为诸如β-内酰胺酶新突变型底物谱的探究提供了新方法。