芥菜型油菜FAE1基因序列特征及其与芥酸含量关系的初步分析

• 作者: 傅廷栋 张修森 徐爱遐 涂金星 肖恩时 马朝芝 黄镇
• 来源期刊: 作物学报
• 关键词: 芥菜型油菜 FAE1 克隆 序列分析
• 年，卷（期）: 2010,（5）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源·分子遗传学
• 页码范围: 794-800
• 分类号: S5
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1006.2010.00794

摘要

采用同源序列法对6个芥菜型油菜(Brassica juncea)品种(高芥酸、中芥酸、低芥酸)、2份白菜型油菜品种(高芥酸和低芥酸)和 1 份黑芥品种的FAE1基因进行克隆和测序表明,9个品种的FAE1基因编码区全长均为1 522 bp,不含内含子,均编码507个氨基酸残基.序列比较表明,芥菜型油菜中有两种FAE1基因序列(BjFAE1.1和BjFAE1.2),其亲缘种白菜型油菜和黑芥中各有一种FAE1基因序列(BrFAE1和BnFAE1),BjFAE1.1对应于白菜型油菜的BrFAE1,BjFAE1.2对应于黑芥的BnFAE1;BjFAE1.1和BjFAE1.2之间存在71 bp处核苷酸变异和Hind Ⅲ不同的酶切位点(第1415位和第1144位),蛋白质水平上存在15处氨基酸变异.比较不同芥酸含量品种的FAE1基因序列表明,BjFAE1.1基因存在2个SNP位点(第968位和第1265位),BjFAE1.2基因也有2个SNP位点(第49位和第237位),这4个SNP位点中有3个位点(第49位、第968位和第1265位)导致蛋白质水平上氨基酸的差异.其中BjFAE1.1基因第968位的碱基变化(C→T)引起的第323位氨基酸变化(Thr→Ile),能够解释芥菜型油菜和白菜型油菜高芥酸到低芥酸(中芥酸)的转变;第1265位的碱基变化(T→C)引起的第422位的氨基酸变化(Phe→Ser),能够部分解释芥菜型油菜的高芥酸到低芥酸(中芥酸)的转变,白菜型油菜的高芥酸和低芥酸品种在该位点的碱基没有变化.BjFAE1.2基因第49位的碱基变化(T→C)引起的第17位氨基酸的变化(Phe→Leu),可以解释芥菜型油菜的中芥酸变成高芥酸(低芥酸).陕北黄芥低芥酸突变株1278→3的FAE1基因序列和国外低芥酸品种比较,只在第1265位出现变异.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	马朝芝	华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室	20	899	13.0	20.0
2	徐爱遐	华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室	17	82	5.0	8.0
4	肖恩时	西北农林科技大学农学院	10	43	3.0	6.0
5	涂金星	华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室	41	1328	21.0	36.0
8	黄镇	西北农林科技大学农学院	13	50	4.0	6.0
9	张修森	西北农林科技大学农学院	3	22	2.0	3.0