隐式生物膜模型及E蛋白折叠模拟

• 作者: 刘剑洪 陈彦涛
• 来源期刊: 深圳大学学报（理工版）
• 学科: 化学
• 关键词: 高分子物理与化学 传染性非典型肺炎冠状病毒 生物膜模型 膜蛋白 蛋白质折叠 格子链
• 年，卷（期）: 2010,（1）
• 所属期刊栏目: 化学与化工
• 页码范围: 60-64
• 页数: 5页
• 分类号: O641|Q67
• 字数: 2139字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2618.2010.01.012

摘要

受计算速度所限,现有生物膜模拟多集中于膜内多肽链片断,对膜两侧的多肽链片断关注较少.通过构建隐式生物膜模型,在格子空间中针对传染性非典型肺炎冠状病毒E蛋白的全序列进行模拟研究.结果表明,E蛋白在折叠过程中存在两个明显的热力学转变:从无规线团开始,生物膜内较强的氢键相互作用促使螺旋形成,导致coil-helix转变;在疏水相互作用下,膜两侧水溶液中的多肽链片断发生坍塌,导致coil-globule转变;最后形成稳定的跨膜构象,且跨膜序列与已有的预测结果基本符合.相关模拟手段体现了很高的计算效率,为后续的膜蛋白聚集体模拟研究提供了可行方法.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘剑洪	深圳大学化学与化工学院深圳市功能高分子重点实验室	180	2389	27.0	40.0
2	陈彦涛	深圳大学化学与化工学院深圳市功能高分子重点实验室	3	5	1.0	2.0