地山雀线粒体基因组全序列的测定和分析

• 作者: 杨超 雷富民 黄原
• 来源期刊: 动物学研究
• 学科: 生物学
• 关键词: 地山雀 雀形目 山雀科 地山雀属 线粒体全基因组 RNA二级结构 中央保守区
• 年，卷（期）: 2010,（4）
• 页码范围: 333-344
• 分类号: Q344.13|Q786|Q959.739
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1141.2010.04333

摘要

基于长距PCR扩增及保守引物步移法测定并注释了地山雀(Pseudopodoces humilis)的线粒体基因组全序列.结果表明,地山雀线粒体基因组全长1.6 809万bp,A+T含量为52.9%,37个基因排列顺序与红原鸡一致.蛋白质基因的起始密码子中,除COI基因为GTG外,其余均为ATG.NDⅠ和ND5基因终止密码子为AGA:COⅡ基凶为AGG:COⅢ和ND4基因为不完全终止密码子T;其余基因均为典型的TAA或TAG.预测了22个tRNA基闪的二级结构,发现tRNAScr(AGN)缺少DHU臂,tRNAPhe的TψC臂存在一单核苷酸插入.预测的地山雀12S和16S rRNA二级结构分别包括3个结构域47个茎环和6个结构域60个茎环. 控制区位于tRNAGlu和tRNAPhe之间,长度1240 bp.控制区结构为高变Ⅰ区、中央保守Ⅱ区和保守序列Ⅲ区3个结构域.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	雷富民	中国科学院动物研究所动物进化与系统学重点实验室	68	1093	20.0	30.0
2	黄原	陕西师范大学生命科学学院	84	847	16.0	24.0
3	杨超	陕西师范大学生命科学学院	4	7	2.0	2.0