溶藻弧菌质粒pVAE259全序列测定与分子生物学特征分析

• 作者: 任春华 罗鹏 胡超群 苏婷
• 来源期刊: 微生物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 溶藻弧菌 质粒 复制区域 开放性阅读框
• 年，卷（期）: 2010,（2）
• 所属期刊栏目: 遗传和分子生物学
• 页码范围: 162-168
• 页数: 7页
• 分类号: Q938
• 语种: 中文

摘要

[目的]获得溶藻弧菌环状质粒pVAE259全序列,分析其分子生物学特征并探索该质粒可能具备的功能.[方法]使用酶切、克隆测序的方法获得pVAE259的全序列,利用软件分析DNA序列和可能的编码蛋白,推测质粒的生物学信息.[结果]pVAE259为闭合环状质粒,全长6,075 bp,GC含量为42.16%.在NCBI中比对发现pVAE259与Vibrio sp.41隐蔽性质粒pPS41具有较高的相似性.我们在序列中找到一个oriT位点,另外全序列的4118-5494 bp推测为质粒复制区域.pVAE259中存在7个氨基酸序列长度大于100的开放式阅读框(ORF):ORF1-ORF7.其中ORF1编码蛋白属于释放酶超级家族(Relaxase Super-family)蛋白,在NCBI数据库中它与大肠杆菌(Escherichia coli)的MobA-like蛋白最相似;ORF2编码蛋白属于复制酶超级家族(Replicase Super-family),它与嗜麦芽寡养单胞菌(Stenotrophomonas maltophilia)的复制蛋白RepA最相似;ORF5与伸长盐单胞菌(Halomonas elongata)质粒pHE1的转移蛋白MobC相似.[结论]根据上述结果及相关文献分析,pVAE259可能是具有转移能力的质粒,该质粒是否影响宿主菌的表型性状还不清楚.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	罗鹏		3	18	2.0	3.0
2	苏婷		1	2	1.0	1.0
3	任春华		1	2	1.0	1.0