苎麻茎皮EST数据库构建及肌动蛋白解聚因子(ADF)和β-tubulin基因时空表达分析

• 作者: 佘玮 康万利 揭雨成 邢虎成 黄明
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 学科: 农学
• 关键词: 苎麻 表达序列标签(EST) 肌动蛋白解聚因子(ADF) β-微管蛋白
• 年，卷（期）: 2010,（2）
• 所属期刊栏目: 研究资源
• 页码范围: 382-388
• 分类号: S5
• 字数: 4754字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2010.02.029

摘要

本研究以封行期的苎麻(Boehmeria nivea(L.)Gaud)的茎皮为材料构建cDNA文库.从文库中随机挑选400个克隆测序获得274条有效序列(GenBank登录号为EH041928～EH041933,EH667190～EH667251,ES584534～ES584595和FG588817-FG588960).生物信息学分析表明:拼接出217个假定独立转录本(TUT),冗余度为20.8%.Blast比对结果获得了91条已知功能基因或具推测功能的基因,其余183个ESTs为未知基因.91条具已知或推测功能的ESTs大致分为9类,其中与细胞壁有关的ESTs占5.5%.对与细胞壁有关基因中的肌动蛋白解聚因子(ADF)和β-tubulin基因进行半定量RT-PCR分析,结果显示这两个基因在4个生长期和5个组织中均有表达,在封行期的茎皮高度表达.提示ADF和β-微管蛋白基因的表达具有时空特异性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	揭雨成	湖南农业大学苎麻研究所湖南省作物种质创新与资源利用重点实验室	80	315	10.0	13.0
2	佘玮	湖南农业大学苎麻研究所湖南省作物种质创新与资源利用重点实验室	37	205	7.0	12.0
3	邢虎成	湖南农业大学苎麻研究所湖南省作物种质创新与资源利用重点实验室	67	267	9.0	12.0
4	康万利	湖南农业大学苎麻研究所湖南省作物种质创新与资源利用重点实验室	11	110	6.0	10.0
5	黄明	湖南农业大学苎麻研究所湖南省作物种质创新与资源利用重点实验室	7	128	4.0	7.0