寄生性吸虫谷胱甘肽过氧化物酶生物信息学分析

• 作者: 何立 章莹 蒋明森 蔡国斌
• 来源期刊: 中国人兽共患病学报
• 学科: 医学
• 关键词: 医学吸虫 谷胱甘肽过氧化物酶 生物信息学 协同进化
• 年，卷（期）: 2010,（4）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 293-298
• 页数: 6页
• 分类号: R383.2
• 字数: 3810字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-2694.2010.04.001

摘要

目的 分析几种重要医学吸虫谷胱甘肽过氧化物酶(glutathione peroxidase,GPx)基因及其编码蛋白的生物学信息,探讨吸虫GPx在生物系统发育中的进化地位.方法 从网络数据库获取各类目标序列,用NCBI Blast、Clustal X、GeneDoc、PHYLIP和SECISearch等工具,以及比较基因组学方法进行信息学分析.结果 获得来自6种不同吸虫共12个GPx基因,分析发现它们均属磷脂氢谷胱甘肽过氧化物酶(PHGPx)家族,各成员之间具有较高的序列同源性(35%～87%).除卫氏并殖吸虫-PHGPx基因外,其他基因开放阅读框内均含有"TGA"密码子,编码硒半胱氨酸,且其3'-端非翻译区均含有硒半胱氨酸插入序列(SECIS).除华支睾吸虫-GPx基因组结构由5个外显子和4个内含子组成外,其他均由6个外显子和5个内含子组成.而且,吸虫的GPx基因"内含子-外显子"结构和脊椎动物的PHGPx基因相似,高度保守.结论 医学吸虫和脊椎动物宿主的PHGPx基因可能来源于共同的祖先,提示寄生虫与宿主之间的相容性和协同进化的特征.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	何立	武汉大学基础医学院寄生虫学教研室	59	210	9.0	11.0
2	蒋明森	武汉大学基础医学院寄生虫学教研室	71	343	10.0	14.0
3	章莹	武汉大学基础医学院医学遗传学教研室	9	38	4.0	6.0
4	蔡国斌	武汉大学基础医学院寄生虫学教研室	15	58	5.0	7.0