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枣树抗坏血酸过氧化物酶基因ZjAPX生物信息学分析及植物表达载体的构建
枣树抗坏血酸过氧化物酶基因ZjAPX生物信息学分析及植物表达载体的构建
作者:
孟玉平
曹冬梅
曹秋芬
许洪仙
郝子琪
原文服务方:
山西农业科学
枣树
抗坏血酸过氧化物酶
生物信息学分析
植物表达载体
摘要:
利用生物信息学软件对已获得的枣树抗坏血酸过氧化物酶基因cDNA序列ZjAPX进行了同源性及功能位点等多项参数分析.结果表明,此序列为全长753 bp的开放读码框(ORF),编码251氨基酸,分子量为62.55 kDa,理论等电点为5.10,为一个膜外蛋白;序列保守性分析表明,该序列具有典型的铁氧化还原蛋白结合区域,属于一个典型的植物亚铁血红素过氧化物酶家族蛋白;氨基酸序列相似性分析表明,该蛋白与已知的其他植物抗坏血酸过氧化物酶APX具有极高的同源性,与可可树APX和陆地棉APX同源性均为93%,命名为 ZjAPX (DDBJ/EMBL/GenBank注册号:AB608053).用Swiss Model程序(http://au.expasy.org/tools/)推测了ZjA PX基因编码蛋白的三维结构.以ZjA PX的cDNA序列为模板,PCR扩增后,经限制性内切酶消化,与PEZR(K)-LNY载体进行重组连接,测序结果显示,其植物表达载体构建成功.此结果为研究枣树抗坏血酸过氧化物酶基因在植物体内的生物学功能以及可能的活性调节方式奠定了基础.
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文献信息
篇名
枣树抗坏血酸过氧化物酶基因ZjAPX生物信息学分析及植物表达载体的构建
来源期刊
山西农业科学
学科
关键词
枣树
抗坏血酸过氧化物酶
生物信息学分析
植物表达载体
年,卷(期)
2011,(5)
所属期刊栏目
生物技术
研究方向
页码范围
400-403
页数
分类号
S665.1
字数
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.1002-2481.2011.05.04
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
孟玉平
山西省农业科学院生物技术研究中心
72
734
16.0
23.0
2
曹秋芬
山西大学生物工程学院
92
817
16.0
22.0
4
曹冬梅
山西省农业科学院园艺研究所
51
554
11.0
21.0
7
郝子琪
山西大学生物工程学院
3
23
3.0
3.0
11
许洪仙
8
10
1.0
3.0
传播情况
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共引文献
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节点文献
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同被引文献
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二级引证文献
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引证文献(4)
二级引证文献(6)
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二级引证文献(6)
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2020(1)
引证文献(1)
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研究主题发展历程
节点文献
枣树
抗坏血酸过氧化物酶
生物信息学分析
植物表达载体
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
山西农业科学
主办单位:
山西省农业科学院
出版周期:
月刊
ISSN:
1002-2481
CN:
14-1113/S
开本:
大16开
出版地:
邮发代号:
创刊时间:
1961-01-01
语种:
chi
出版文献量(篇)
7094
总下载数(次)
0
总被引数(次)
37802
相关基金
山西省自然科学基金
英文译名:
Shanxi Natural Science Foundation
官方网址:
http://sxnsfc.sxinfo.gov.cn/sxnsf/index.aspx
项目类型:
学科类型:
期刊文献
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