流行性腮腺炎疫苗株S79全基因序列测定与分析

• 作者: 于洁 卫江波 张学峰 张靖 李启明 梁宇 陈实 靳玉琴 马智静
• 来源期刊: 中华微生物学和免疫学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 腮腺炎病毒 噬斑纯化 RT-PCR 序列分析 S79
• 年，卷（期）: 2010,（12）
• 页码范围: 1105-1109
• 分类号: R5
• 字数: 4168字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.issn.0254-5101.2010.12.009

摘要

目的 腮腺炎疫苗株S79工作种子噬斑纯化及全基因组测序,针对国内已经分离出的毒株,从分子生物学角度探讨疫苗保护力相关问题.方法 噬斑纯化S79疫苗株,利用RT-PCR分段扩增S79株两种亚株的全基因并测序,比较S79株与其来源株Jeryl Lynn(JL)核酸序列差异;从GenBank中获得WHO各基因型参考株和中国腮腺炎流行株疏水蛋白(SH)序列,分析病毒株和疫苗株遗传距离,并构建基因亲缘性关系树.结果 S79疫苗株由两种亚株构成,比例为2∶5(major∶minor),获得全基因序列并递交GenBank;与相应的JL株相比,核苷酸序列同源性分别为99.7%和100%.亚株序列中存在散在区段异源重组.S79疫苗株为A基因型,中国的流行株为F基因型,遗传距离为11.2%～20.0%.结论 S79疫苗株由两种亚株构成,两亚株的全基因序列与JL株基本一致,但亚株的比例与国际上应用的其他JL疫苗株存在较大差异.疫苗株与中国流行株不属于同一基因型,遗传距离较远.S79疫苗免疫保护效果的差异可能主要与疫苗株和流行株不属于同一基因型有关.