利用ITS1和ITS4通用引物扩增香蕉枯萎病菌核酸片段鉴定其生理小种

• 作者: 周林 喻国辉 曹永军 杨紫红 程萍 黎永坚
• 来源期刊: 热带作物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 香蕉枯萎病菌 rDNA-ITS 系统发育分析
• 年，卷（期）: 2010,（7）
• 页码范围: 1098-1102
• 分类号: S436.8
• 字数: 2669字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2561.2010.07.009

摘要

利用真菌核糖体rDNA区通用引物ITS1和ITS4,扩增采集自香蕉的13株镰刀菌包括18S rDNA部分序列、ITS1-5.8S-ITS2全部序列和28S rDNA部分序列的片段,通过BLAST序列比对分析,确定13株菌为尖孢镰刀菌[Fusarium oxysporum].采用最大简约法,以层出镰刀菌[F.proliferatum(EU151490)]和茄病镰刀菌[F.solani(GQ376116)]为外群,将13株菌的序列与BLAST检索获得的尖镰孢古巴专化型(F.oxysporum f.sp.Cubense)相应序列构建了系统发育树.系统发育分析结果显示,13株菌与NCBI登录的4个尖镰孢古巴专化型菌株一起被分成3个亚群,亚群聚类结果与回接鉴定结果及文献报道的生理小种结果完全一致.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	程萍		40	571	14.0	22.0
2	曹永军	华南农业大学资源环境学院	13	161	5.0	12.0
4	喻国辉		37	613	15.0	23.0
5	黎永坚		21	312	12.0	17.0
8	杨紫红		13	243	7.0	13.0
9	周林	华中农业大学生命科学技术学院	8	150	6.0	8.0