长薄鳅(Leptobotia elongata)线粒体DNA控制区遗传多样性研究

• 作者: 刘光迅 周剑 朱健 李建林 杜军 赵刚 陈先均
• 来源期刊: 西南农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 长薄鳅 线粒体DNA 控制区序列 种群遗传结构 遗传多样性
• 年，卷（期）: 2010,（3）
• 页码范围: 930-937
• 分类号: S965.116
• 字数: 5425字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-4829.2010.03.068

摘要

对采自泸州(长江干流)、南溪(长江干流)、柏溪(金沙江段)、攀枝花(雅砻江段)、重庆(嘉陵江段)4个流域的45尾长薄鳅(Leptobotia elongata)的线粒体DNA控制区部分序列(798 bp)进行了扩增,共检测出19个单倍型,未发现群体间有共享的单倍型,5群体单倍型多样性在0.833～1.000之间,显示不同流域的长薄鳅群体单倍型类型较为丰富.分析了D-Loop的碱基组成、变异情况和核苷酸序列差异,计算了核苷酸多样性(π)、单倍型多样性(h)、FST值和基因流数值(Nm),构建了长薄鳅不同单倍型分子系统树和中间网络图.5个群体内各序列核苷酸多样性指数 (π) 在0.276 %～0.905 %之间;群体间遗传距离范围为0.0028～0.0092,结果显示长薄鳅自然群体存在较丰富的线粒体控制区序列多态性(h＝0.916,π＝0.00450),Tajima's D统计(–2.09890)和Fu's Fs统计(–7.56940)分析都显示各种群之间差异显著(P<0.05),但FST值(FST<0.05)的分析结果显示重庆、柏溪、南溪、攀枝花和泸洲种群间没有明显的遗传分化,暗示了柏溪和攀枝花种群历史上,可能发生过群体扩张和种群瓶颈,而泸州、南溪和重庆种群一直是平衡种群.Nm值计算结果显示各地理种群间无明显基因交流,暗示了长薄鳅虽然在各条不同的河流里洄游产卵,但并未因此而产生独立分化的群体.所有群体中,泸洲和攀枝花种群的遗传多样性比重庆、柏溪和南溪种群丰富.进行长薄鳅人工繁殖时,可以将遗传多样性较丰富地区的个体补充到人工繁殖中来,以提高长薄鳅的遗传素质,为人工增殖放流提供遗传多样性更丰富的个体.